Раз это комплекс, то должен быть комплект оборудования и необходимые лицензии. Ставить linux на наладонники у вас не получится. А так для ХроноГраф Журнал заявлена поддержка linux. Для остального как для 1С 7.7, т.е. wine@etersoft. Обращайтесь к производителю за разъяснениями.